无锡地区ST15型耐碳青霉烯类肺炎克雷伯菌耐药及毒力特征分析
•万林,刘雨彤,李雄,沈兰凤,胡仁静
•2026,25(3):325-334 .Doi: 10.12138/j.issn.1671-9638.20262921
摘要:
目的 分析江苏无锡地区临床分离的ST15型耐碳青霉烯类肺炎克雷伯菌(CRKP)的分子流行病学及基因组进化关系,为制定区域化精准防控策略提供科学依据。方法 收集2021年1月—2024年12月无锡市某三级甲等医院临床分离的18株非重复ST15型CRKP进行菌种鉴定及药敏试验。应用Illumina NovaSeq X Plus平台对所有菌株进行全基因组二代测序。...目的 分析江苏无锡地区临床分离的ST15型耐碳青霉烯类肺炎克雷伯菌(CRKP)的分子流行病学及基因组进化关系,为制定区域化精准防控策略提供科学依据。方法 收集2021年1月—2024年12月无锡市某三级甲等医院临床分离的18株非重复ST15型CRKP进行菌种鉴定及药敏试验。应用Illumina NovaSeq X Plus平台对所有菌株进行全基因组二代测序。 基于此,筛选出2株高毒力菌株,利用Oxford Nanopore PromethION 平台获得高质量完成图基因组,分析菌株的耐药基因、毒力基因、质粒携带情况及基因组结构特征,并基于单核苷酸多态性(SNP)构建系统发育树。利用大蜡螟感染模型评估所选菌株的毒力。结果 药敏试验结果显示,所有菌株对碳青霉烯类等广谱抗菌药物普遍耐药,但对替加环素及多黏菌素均敏感。18例感染患者中,年龄≥60岁者占77.8%,男性占77.8%;标本来源以呼吸道标本(占44.4%,包括痰7株、支气管肺泡灌洗液1株)及血标本(占33.3%,6株)为主,其余来源于胆汁、尿液及导管。基因组进化分析表明,菌株可分为KL19-O1和KL112-O1两个克隆群,分别携带blaKPC-2、blaNDM-5和blaOXA-232等碳青霉烯酶基因。其中,4株菌为高毒力合并碳青霉烯类耐药,呈现独特的rmpA2+/iutA+/rmpA-毒力基因谱;大蜡螟感染模型证实其毒力高于非高毒力菌株(P=0.015)。质粒分析显示,blaKPC-2位于IncFIIK型质粒的IS26-Tn4401b-IS26复合转座子结构内,blaOXA-232位于ColKP3型质粒,而毒力基因则由IncHI1B(pNDM-MAR)/IncFIBK37融合质粒携带。结论 无锡地区ST15 CRKP以KL19-O1-blaKPC-2克隆流行为主,但已出现携带rmpA2+/iutA+/rmpA-特征、属于KL112-O1型的高毒力亚克隆。持续监测ST15-CRKP的基因组进化对指导临床用药和制定区域化精准防控策略至关重要。
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关键词:肺炎克雷伯菌;ST15;碳青霉烯类耐药;高毒力表型;分子流行病学;全基因组测序